貝子廟位於錫林浩特市額爾登敖包山麓南坡。貝子廟蒙古語稱“班迪達格根廟”，清廷賜名“崇善寺”。又因主持建廟的是格根(活佛)根巴拉朱爾倫德布和東阿巴哈納爾旗貝子巴拉吉日道爾吉，故又俗稱“貝子廟”，一直流傳至今。

貝子廟始建於清乾隆八年(1743年)，經七代活佛六次大規模擴建而成，占地面積達1.2平方公里，建築面積達2萬餘平方米。貝子廟是該廟總的俗稱，它由於宗教功能不同而由相互毗鄰的十三座自成一體的廟(殿)組成，各有其名稱。其中有八座大型殿堂、幾十座小殿堂、十三座廟倉(紮薩)及兩千余間喇嘛僧
房，是內蒙古著名的四大喇嘛廟之一。

貝子廟依山取勢，前低後高，朝向東南，它以主殿朝克沁殿(行政教務部)為中心，其他殿(廟)在其左右成“一”字橫排，東側有卻日殿(哲學部，俗稱東廟)、珠都巴殿(密宗學部)、曼巴殿(醫學部)、丁克爾殿(天文、曆算、堪輿部)和甘珠爾廟；西側有明幹殿(千佛殿及其後部的譯經殿)、新拉布仁(活佛府)。在貝子廟兩翼還有呼圖格圖達喇嘛廟、老苯喇嘛廟、額仁吐喇嘛廟等。朝克沁、卻日、明幹三殿(廟)，均以前置大照壁、外砌矮牆的廣場為前導，各三進院落，紅牆圍砌，構成貝子廟的主體，其地位極高。貝子廟群體週邊稍遠處，於乾、艮、巽、坤四方位置四座覆缽式喇嘛塔，四塔遙相呼應。貝子廟總體佈局井然有序，建築地位主次分明，在內蒙古藏傳佛教寺廟中，這樣的齊整排列佈局尚屬首例。

貝子廟建築均為大木結構，按其造型可分為重簷兩層前置抱廈大木歇山式、前置簷廊大木硬山式、前簷廊大木卷棚硬山式及大木無廊卷棚硬山式等四個類型。建築平面佈局上嚴格按照傳統的中軸對稱之制布列，朝克沁殿因屬政教中心，殿堂布列較疏，但重點突出，肅穆幽深。

貝子廟是千里錫林草原上藏傳佛教聖地，也是各學部齊全的綜合性佛教學府，在當時生產力水準低下，在草原深處，能夠營造起如此規模、技藝非凡的大型建築群組，令人驚歎。