清代平定準噶爾上層貴族叛亂後，於乾隆二十七年(1762年)設“伊犁將軍”管轄全疆，伊犁將軍的駐地就在惠遠城。乾隆中葉在這裏先後建造了九座城堡，其中惠遠城最大，而且居中，其餘八座城堡，有的在西面和北面作為前哨，有的在東、南為後援基地，如眾星捧月一般。惠遠老城在伊黎河北岸，建於清乾隆二十八年(1763年)，三十年後又向東擴建。後因河水向北侵蝕，加上同治年間遭到沙俄入侵，終於完全荒廢。現在大半個城都已塌入河中，原來城中心的鐘鼓樓，現在只留下瀕臨大河的土台基。城內當年有十字大街、縱橫巷道，鼓樓前南街東面第二條巷子名叫“寬巷”，當年林則徐謫戍新疆到伊犁後就住在這裏。清光緒八年(1882年)，在惠遠老城北面5公里處按老城規模重建惠遠新城，就是現在霍城縣惠遠鄉所在地。城牆大體完好，馬面、甕城、馬道、護城河都完整可見，城中的鐘鼓樓已修葺一新，將軍府內還有部分建築保持當年模樣，其餘都成為新建的房屋或辟為耕地了。