蓬萊閣建在古登州城北臨海陡起的丹崖山上。丹崖山通體赭紅，拔海而起，氣勢雄偉，風光壯麗。蓬萊閣高踞丹崖山巔，北望滄溟無限，南望煙雨萬家，西有老北山與丹崖相峙，東有沙坪闊水，環境異常優美。

蓬萊閣位於丹崖山頂與蓬萊的海市蜃樓景觀有關。站在峰巔北望大海，東眺日出，前方又有長山列島相輝映，更妙的是海市蜃樓每每出現於長山列島附近，丹崖山是觀瞻的絕佳之處。

據《蓬萊閣志》載，唐以前蓬萊閣原是一根柱子的架閣，稱為神工，宋時改建成兩層，即海神廣德王廟(也稱龍王廟)。北宋嘉?六年(1061年)，蓬萊太守朱處約將龍王廟西移至現在的位置，而在原地上建起了蓬萊閣。

北宋宣和四年(1122年)又建天后宮於閣西，從此，蓬萊閣與海市蜃樓便成為海內名士讚譽的奇境。據舊縣誌記載：明洪熙元年(1425年)、成化七年(1471年)分別進行過修葺，明萬曆十五年(1587年)進行過修葺和擴建。明崇禎九年(1636年)，太守陳仲盛“葺治城垣，修建海神、天妃諸廟”。清嘉慶二十三年(1818年)又進行擴建和修葺，據《重修蓬萊閣記》載：“閣基憑舊，而壯麗逾前。閣外有回廊，東偏作室如舫，為登降所由；前兩翼對啟數楹，為憩息之所。皆昔無而今增。閣之東西賓日樓、海市亭皆久廢而更立。惟避風亭不改其舊貫，第易簷以為新。”規模與今天相仿。據《蓬萊閣志》記載，原蓬萊閣南還建有多壽亭，是明萬曆十八年(1590年)知府王雲鷺建的。據考證，丹崖山上的建築以上清宮為最早，並逐漸形成了以蓬萊閣為中心的南北軸線。

蓬萊閣建築群融遊覽、禮佛、拜教功能於一爐，運用了中國古老的園林和宗教建築的藝術手法。特別是蓬萊閣，由於它自身特有的魅力，早就成為我國四大名樓之一，為我們留下了寶貴的文化藝術遺產。

丹崖山北高南低，終北是絕壁臨海，蓬萊閣建築群依山就勢，層層推進，造成疏密錯落的總體佈局。按建築所處位置可劃分為前區、中區、後區三部分。

前區位於山腳，包括彌陀寺、萬民感德碑亭和丹崖仙境坊，是整個建築群的引導。丹崖仙境坊尺度適宜，造型優美。

中區位於山腰，主要是祭祀建築。自西向東形成三條南北軸線，主要建築分別為龍王宮、天后宮和上清宮。龍王宮軸線較短，它包括宮門、兩側配殿、龍王宮主殿，並附以養生殿，是祭祀海神廣德王的處所。上清宮軸線包括白雲宮門、原白雲宮殿(現花壇處)、吳公祠、上清宮前殿、上清宮正殿。在上清宮東側還建有呂祖殿一組建築，它包括垂花門、兩側配殿、呂祖殿。

中區最主要的建築群是天后宮，自南向北排列有顯靈門、鐘鼓樓、戲樓、天后宮前殿、垂花門、兩側配殿、天后宮正殿、天后宮寢宮，是祭祀海神的建築群。

後區是以蓬萊閣為中心的濱海建築群，位於丹崖山巔，對全區建築起控制作用。自西向東排列著澄碧軒、避風亭、蓬萊閣、臥碑亭、蘇公祠、賓日樓、觀瀾亭以及崖邊的城牆建築，是觀賞風景的好去處。

前區建築

(1)萬民感德碑亭。為清代建築，平面八邊形，內外兩圈柱，單簷八角屋頂，一斗三升斗栱，覆灰瓦，有寶頂，無彩畫，古樸大方。

(2)丹崖仙境坊。木質結構，四柱三樓大式硬山頂，明間斗栱七踩，正中兩攢，柱邊各為半攢，次間枋上為五踩斗栱，柱上無斗栱，灰瓦覆頂，樸素無華。

中區建築

(1)龍王宮。始建于初唐，元中統和明洪武、萬曆年間均曾修葺。建築主體面闊三間12.3米，進深三間7.4米，內部梁架全部用鏇子彩畫。前兩金柱為盤龍柱，做工精細，前出抱廈。外觀為七架檁廡殿頂。

(2)天后宮戲樓。分前後兩部分，前部為後臺，兩層，設有平座，面闊三間10.29米，進深兩間4.9米，五架檁，前簷廊，大式硬山頂；後部為戲臺，是給海神祝壽的地方，六架檁，卷棚歇山頂。

(3)天后宮前殿。面闊三間10.75米，進深三間5.49米，七架檁，前簷廊，大式硬山頂，上覆灰瓦，內部為徹上露明造，斗栱為一斗三升。

(4)天后宮正殿。面闊五間14.79米，進深三間9.34米，殿身平面柱網形式為金廂鬥底槽式，內部為徹上露明造。前出抱廈，斗栱均為一斗三升。頂為九架檁大式硬山頂，上覆黃琉璃瓦。

(5)天后宮寢宮。面闊三間12.7米，進深兩間5.1米，重簷大式硬山頂，二層上設有平座，底層設天后全身塑像。上、下兩層均不設斗栱。

(6)上清宮前殿。面闊三間10.25米，進深三間5.4米，建於高臺之上，七架檁，前外廊，大式硬山頂，灰瓦白牆，榜上有彩畫，無斗栱。

(7)上清宮正殿。立於臺階之上，面闊五間12.96米，進深六間7.3米，運用減柱造，分別減去兩根中柱和四根外金柱，室內為徹上露明造，七架檁，單簷歇山頂。中柱直承脊頂，內部宏敞，屋頂覆黃琉璃瓦，出簷較深。

(8)呂祖殿。位於上清宮東側，建於九重臺階之上，清光緒三年(1877年)建，祭呂洞賓，面闊8.59米，進深7.1米，八架檁，前外廊，大式硬山頂，灰瓦白牆，斗栱為一斗三升，內部為徹上露明造。

後區建築

(1)蓬萊閣。外觀兩層，二層設有回廊，頂為重簷歇山頂，上覆黃琉璃瓦。閣面闊五間13.7米，進深五間7.32米，分內外兩圈柱，平面柱網形式為金廂鬥底槽式，進深方向都減去與金柱相對平行的簷柱。下層牆體只在南面開有門窗，明間內設有附柱及附梁，結構相當穩固。下層內不設登閣的樓梯，而由兩側“造室如舫”穿室登臨。二層北面牆體封閉，其他三面則開門窗，室內正中匾額題“蓬萊閣”三字，雄渾有力，為清代鐵保所書，左側為清代古畫，描寫的是蓬萊閣的全景。下層簷下設有斗栱，明、次間兩攢，梢間一攢，均為一斗三升。上層屋簷下不設斗栱，梁出頭呈卷雲頭形，上承正心桁和挑簷桁，出簷深遠，簷下繪鏇子彩畫。

(2)澄碧軒。面闊三間7.85米，進深三間4.79米，七架檁，前簷廊，大式硬山頂，為題詩作畫之所。

(3)避風亭。面闊三間8.1米，進深一間4.64米，五架檁，大式硬山頂。

(4)臥碑亭。因有蘇軾《海市詩》及《題吳道子畫後》臥碑而得名，面闊三間6.1米，進深一間4.1米，五架檁，大式硬山頂。

(5)蘇公祠。面闊三間8.6米，進深一間3.35米，六架檁，卷棚頂，滿壁石刻。

(6)賓日樓。建造年代不詳，重簷八角，底層有回廊，主體為磚構，八面開圓窗，可供觀賞。

(7)普照樓。即燈樓，清登州府同知雷樹枚建，外觀為三層，第三層有腰簷平座，單簷六角攢尖頂。